In silico and in vitro evaluation of primers for molecular differentiation of Leishmania species / Avaliação in silico e in vitro de iniciadores para a diferenciação molecular de espécies de Leishmania

Abstract Leishmaniasis is a zoonotic disease caused by over 20 species of protozoan parasites of the genus Leishmania. Infection is commonly spread by sandflies and produces a wide spectrum of clinical signs and symptoms. Therefore, from an epidemiological and therapeutic standpoint, it is important to detect and differentiate Leishmania spp. The objective of this study was to combinate in silico and in vitro strategies to evaluate the analytical specificity of primers previously described in the literature. According to electronic PCR (e-PCR) analysis, 23 out of 141 pairs of primers selected through literature search matched their previously reported analytical specificity. In vitro evaluation of nine of these primer pairs by quantitative PCR (qPCR) confirmed the analytical specificity of five of them at the level of Leishmania spp., L. mexicana complex or Leishmania and Viannia subgenera. Based on these findings, the combination of e-PCR and qPCR is suggested to be a valuable approach to maximize the specificity of new primer pairs for the laboratory diagnosis of infections with Leishmania spp.

Resumo As leishmanioses são zoonoses causadas por mais de 20 espécies de protozoários do gênero Leishmania. As infecções são comumente disseminadas por flebotomíneos e causam um amplo espectro de manifestações clínicas. Portanto, a detecção e diferenciação de espécies de Leishmania são importantes do ponto de vista epidemiológico e terapêutico. O objetivo deste estudo foi combinar estratégias in silico e in vitro para avaliar a especificidade analítica dos primers descritos anteriormente na literatura. De acordo com a PCR eletrônica (e-PCR), 23 dos 141 pares de primers selecionados por meio de pesquisa da literatura estavam de acordo com a especificidade analítica anteriormente relatada. A avaliação in vitro de nove desses pares de primers, por PCR quantitativa (qPCR), confirmou a especificidade analítica de cinco deles ao nível de espécie de Leishmania, do complexo L. mexicana ou dos subgêneros Leishmania e Viannia. Com base nos resultados, sugere-se que a combinação de e-PCR e qPCR é uma abordagem valiosa para a validação e maximização da especificidade de novos pares de primers para o diagnóstico laboratorial de infecções com Leishmania spp.

Controle da leishmaniose visceral canina por eutanásia: estimativa de efeito baseado em inquérito e modelagem matemática / Control of canine visceral leishmaniasis by euthanasia: estimated effect based on a survey and mathematical modeling / Control de la leishmaniasis visceral canina por eutanasia: estimación del efecto basado en una encuesta y modelo matemático

A leishmaniose visceral é uma doença emergente e negligenciada em processo de expansão para áreas urbanas. A incidência da doença humana está relacionada com a infecção canina. Araçatuba e Birigui são municípios do Estado de São Paulo, Brasil, com soroprevalência da infecção canina de 8 a 10%, que empregam estratégias de controle voltadas ao reservatório canino baseado em inquérito sorológico e eutanásia dos cães soropositivos. Usando dados desses programas de controle para parametrizar modelos matemáticos, este estudo avaliou a eficácia dessas atividades. Estimamos que o controle atualmente empregado é capaz de reduzir em cerca de 20% a incidência de casos de leishmaniose visceral canina (LVC). Considerando-se um controle contínuo e um esforço das atividades de inquérito sorológico igual ao triplo da média do observado em Araçatuba e Birigui, a atividade de eutanásia de cães com diagnóstico positivo seria efetiva para o controle da infecção canina. Embora teoricamente possível, na prática, o controle da LVC com as estratégias preconizadas atualmente é insuficiente, pois exigiria superpor dificuldades enfrentadas por estas atividades como falta de recursos materiais, humanos e financeiros, além das questões éticas e jurídicas associadas.

Visceral leishmaniasis is an emerging and neglected disease that is currently expanding to urban areas. The incidence of human disease is related to canine infection. Araçatuba and Birigui are municipalities (counties) in the state of São Paulo, Brazil, with 8-10% seroprevalence of canine infection and that employ control strategies targeting the canine reservoir, based on serological survey and culling of seropositive dogs. Using data from these control programs to parameterize mathematical models, this study assessed the efficacy of these activities. We estimated that current control is capable of reducing the incidence of canine visceral leishmaniasis (CVL) by approximately 20%. Assuming continuous control and three times the current serological survey activities in Araçatuba and Birigui, culling dogs with a positive CVL diagnosis would be effective for the control of canine infection. Although theoretically possible, in practice the control of CVL with the currently recommended strategies is insufficient, since it would require overcoming the difficulties in these activities, such as lack of material, human, and financial resources, besides associated ethical and legal issues.

La leishmaniasis visceral es una enfermedad emergente y pasada por alto en proceso de expansión hacia áreas urbanas. La incidencia de la enfermedad humana está relacionada con la infección canina. Araçatuba y Birigui son municipios del estado de São Paulo, Brasil, con una seroprevalencia de infección canina de un 8 a un 10% que emplean estrategias de control dirigidas al reservorio canino, basado en una encuesta serológica y eutanasia de los perros seropositivos. Usando datos de esos programas de control para proporcionar parámetros en modelos matemáticos, este estudio evaluó la eficacia de esas actividades. Estimamos que el control actualmente empleado es capaz de reducir cerca de un 20% la incidencia de casos de leishmaniasis visceral canina (LVC). Si se considera un control continuo y un esfuerzo de las actividades de encuesta serológica igual al triple de la media de lo observado en Araçatuba y Birigui, la actividad de eutanasia de perros con diagnóstico positivo sería efectiva para el control de la infección canina. A pesar de que teóricamente es posible, en la práctica el control de la LVC con las estrategias preconizadas actualmente es insuficiente, puesto que exigiría superar dificultades a las que se enfrentan estas actividades como la falta de recursos materiales, humanos y financieros, además de las cuestiones éticas y jurídicas asociadas.

Human visceral leishmaniasis and relationship with vector and canine control measures / Leishmaniose visceral em humanos e relação com medidas de controle vetorial e canino

ABSTRACT OBJECTIVE Estimate the coverage of control measures of visceral leishmaniasis and relate them with the occurrence of human visceral leishmaniasis in endemic urban area. METHODS Cases of human and canine visceral leishmaniasis were considered as study population and evaluated by a serological survey conducted in Araçatuba, state São Paulo, from 2007 to 2015. The cases of human visceral leishmaniasis were geocoded by the address of the patients and the canine disease by the address of the dogs' owners. The coverage of serological survey, euthanasia, and insecticide spraying was calculated, as well as the canine seroprevalence and the incidence rates of human visceral leishmaniasis. The relationship between human visceral leishmaniasis and control measures was evaluated, as well as the seroprevalence by comparing maps and by linear regression. The relationship between the canine and the human disease was also evaluated by the Ripley's K function. RESULTS The incidence rates of human visceral leishmaniasis showed a period of decline (2007 to 2009) and a period of stability (2010 to 2015), a behavior similar to that of canine seroprevalence. In general, the coverage of control measures was low, and the non-association with the incidence of human visceral leishmaniasis can be a result of the period analyzed and of the small number of analyzed units (sectors of the Superintendence for the Control of Endemic Diseases). The distribution of human cases showed spatial dependence with the distribution of seropositive dogs from 2007 to 2009. CONCLUSIONS This study reaffirmed the relationship between the occurrence of the disease in humans and dogs, it verified a decrease in the rates of visceral leishmaniasis in Araçatuba over time, even at low coverage of control activities. However, further studies are needed to determine if factors beyond monitoring and control measures are involved in the reduction of incidences.

RESUMO OBJETIVO Estimar a cobertura das atividades de controle da leishmaniose visceral e relacioná-las com a ocorrência de leishmaniose visceral em humanos em área urbana endêmica. MÉTODOS Foram considerados como população de estudo os casos de leishmaniose visceral em humanos e em cães avaliados por inquérito sorológico censitário realizado em Araçatuba, SP, de 2007 a 2015. Os casos de leishmaniose visceral em humanos foram geocodificados pelo endereço de residência dos pacientes e, os cães, pelo endereço de residências dos respectivos tutores. Foram calculadas as coberturas do inquérito sorológico, da eutanásia e de borrifação de inseticida, as soroprevalências caninas e as taxas de incidência de leishmaniose visceral em humanos. A relação entre a leishmaniose visceral em humanos e as medidas de controle, bem como a soroprevalência foram avaliadas por comparação de mapas e por meio de regressão linear. A relação entre a doença canina e a humana também foi avaliada por meio da função K de Ripley . RESULTADOS As taxas de incidência de leishmaniose visceral em humanos apresentaram um período de declínio (2007 a 2009) e um período de estabilidade (2010 a 2015), comportamento semelhante ao das soroprevalências caninas. Em geral, a cobertura das medidas de controle foi baixa e a não associação com a incidência de leishmaniose visceral em humanos pode ser consequência do período analisado e do número pequeno de unidades analisadas (setores da Superintendência de Controle de Endemias). A distribuição dos casos humanos apresentou dependência espacial com a distribuição dos cães soropositivos de 2007 a 2009. CONCLUSÕES Este trabalho reafirmou a relação entre a ocorrência da doença no homem e no cão, verificou a diminuição das taxas de leishmaniose visceral em humanos e em cães em Araçatuba ao longo do tempo, mesmo em baixa cobertura das atividades de controle. Entretanto, novos estudos são necessários para averiguar se fatores além das atividades de vigilância e controle estariam envolvidos na diminuição das incidências.

Age structure of owned dogs under compulsory culling in a visceral leishmaniasis endemic area / A estrutura etária de cães com donos numa área endêmica de leishmaniose visceral / Estructura etaria de la población canina domiciliada en un área endémica con leishmaniasis visceral canina

Abstract: The age structure of the dog population is essential for planning and evaluating control programs for zoonotic diseases. We analyzed data of an owned-dog census in order to characterize, for the first time, the structure of a dog population under compulsory culling in a visceral leishmaniasis endemic area (Panorama, São Paulo State, Brazil) that recorded a dog-culling rate of 28% in the year of the study. Data on 1,329 households and 1,671 owned dogs revealed an owned dog:human ratio of 1:7. The mean age of dogs was estimated at 1.73 years; the age pyramid indicated high birth and mortality rates at the first year of age with an estimated cumulative mortality of 78% at the third year of age and expected life span of 2.75 years. In spite of the high mortality, a growth projection simulation suggested that the population has potential to grow in a logarithmic scale over the years. The estimated parameters can be further applied in models to maximize the impact and minimize financial inputs of visceral leishmaniasis control measures.

Resumo: É importante conhecer a estrutura etária da população canina para melhor planejar e avaliar os programas de controle de zoonoses. Os autores analisaram os dados de um censo de cães com donos para caracterizar, pela primeira vez, a estrutura etária de uma população canina sujeita à eliminação compulsória numa área endêmica de leishmaniose visceral (Panorama, Estado de São Paulo, Brasil) que registrou uma taxa de eliminação canina de 28% no ano do estudo. Os dados para 1.329 domicílios e 1.671 cães com donos mostraram uma razão de cães para humanos de 1:7. A média de idade dos cães foi estimada em 1,73 anos; a pirâmide etária indicou altas taxas de natalidade e de mortalidade no primeiro ano de vida, com uma estimativa de mortalidade cumulativa de 78% aos três anos de idade, e uma expectativa de vida de 2,75 anos. Apesar da alta mortalidade, uma simulação de projeção de crescimento sugeriu que a população tem o potencial de crescer numa escala logarítmica ao longo dos anos. Os parâmetros estimados podem ser aplicados também a modelos para maximizar o impacto e minimizar os insumos financeiros de medidas de controle da leishmaniose visceral.

Resumen: El conocimiento de la estructura etaria de una población de perros es esencial para la planificación de programas de control de zoonosis. Se analizaron datos de un censo de población canina domiciliada, con el objetivo de caracterizar, por primera vez, la estructura de una población de perros domiciliados en un área donde la eutanasia de perros positivos en leishmaniasis visceral es obligatoria (Panorama, São Paulo, Brasil), y que registró un 28% de casos de eutanasia en el año en que el censo fue realizado. Los datos de 1.329 domicilios y 1.671 perros resultaron en una razón perro:hombre de 1:7. La edad media de los perros fue estimada en 1,73 años; la pirámide de edad indica altas tasas de nacimiento y mortalidad hasta 1 año de vida, con tasa de mortalidad acumulada de un 78% en el tercer año de vida, y expectativa de vida de 2,75 años. A pesar de la alta tasa de mortalidad, la simulación de crecimiento poblacional sugiere que esta población tiene potencial de crecimiento en escala logarítmica a lo largo de los años. Los parámetros estimados pueden ser utilizados en modelos para maximizar el impacto y minimizar los costes de las medidas de control de la enfermedad.

Serological, parasitological and molecular tests for canine visceral leishmaniosis diagnosis in a longitudinal study / Testes sorológicos, parasitológicos e moleculares para o diagnóstico da leishmaniose visceral canina em estudo longitudinal

Abstract One of the measures to control visceral leishmaniosis (VL) in Brazil is the identification and culling of the canine reservoir. There is much controversy concerning this strategy, including the proper identification of positive dogs and the fact that the host-parasite relationship changes over time make it more challenging. A dynamic cohort of 62 dogs was followed every three months using serological and parasitological examinations and PCR. Positivity by PCR was higher than by serology and by parasitological examinations and showed a tendency to decrease over time, while serology tended to increase after six months. Concomitant positivity in all tests was observed in 10.4% of the samples, and negativity in 29.1%. Overall sensitivity ranged from 43.6 to 64.1%, and was not uniform over time. The proportion of dogs with or without clinical signs was not different by cytology or PCR but PCR was able to identify a larger number of asymptomatic dogs compared to ELISA and immunochromatography. PCR can be useful for surveillance of areas where cases of canine VL have not yet been detected and in which control strategies can be implemented to limit the spread of the disease. Despite the advance in diagnostic tools CVL diagnosis remains a challenge.

Resumo Uma das medidas de controle da leishmaniose visceral (LV) no Brasil se baseia na identificação e eliminação do reservatório canino. Existe considerável controvérsia relativa a esta estratégia incluindo a correta identificação dos cães positivos e a variação temporal da relação hospedeiro-parasita, o que torna esta medida ainda mais desafiadora. Uma coorte dinâmica de 62 cães foi acompanhada trimestralmente utilizando-se métodos sorológicos, parasitológicos e a PCR. A taxa de positividade por PCR foi maior em comparação à dos métodos sorológicos e parasitológicos, e mostrou tendência à diminuição com o passar do tempo, enquanto que a positividade sorológica apresentou tendência a aumento, após seis meses. Observou-se positividade concomitante em todos os testes em 10,4% das amostras e, negatividade concomitante, em 29,1%. A sensibilidade geral variou de 43,6% a 64,1%, não sendo uniforme ao longo do estudo. A proporção de cães com e sem sinais clínicos que foram positivos ao exame parasitológico ou à PCR não foi estatisticamente diferente. Contudo, foi possível identificar como positivos um maior número de animais assintomáticos por meio da técnica de PCR, em comparação aos testes ELISA e imunocromatográfico. A PCR pode ser bastante útil para a vigilância epidemiológica de áreas onde casos de LV canina ainda não tenham sido descritos e onde estratégias de controle podem ser implantadas para limitar a disseminação da doença. Não obstante o avanço nas ferramentas diagnósticas, diagnosticar a LVC continua um desafio.

Usefulness of serological ELISA assay for Taenia saginata to detect naturally infected bovines / Utilização de teste sorológico ELISA para a detecção de bovinos naturalmente infectados por Taenia saginata

Bovine cysticercosis, a cosmopolitan disease caused by Taenia saginata, leads to economic losses due to carcass devaluation at slaughter. Sanitary inspection at slaughterhouses, the routine diagnostic method in Brazil, lacks the necessary sensitivity to detect the mildly infected cattle that are typically encoutered in Brazil. In this study we have tested cattle sera from animals diagnosed as positive and negative by veterianry inspection for (1) anti-parasite antibodies using metacestodes antigens (T. solium vesicular fluid and T. saginata secretions) and (2) the HP10 secreted antigen of viable metacestodes. The cut-off values were calculated by ROC curve for intense and mild infections conditions, and by the classical method ( X + 2DP for negative samples). The sensitivity and specificity of these diagnostic tests were different depending on the assumed cut-off value and, importantly, whether the infection was mild or intense. In spite of these observations, however, such ELISA assays for serum antibodies and parasite antigens constitute an important tool for epidemiological porposes, and in establishing priorities for the control of bovine cysticercosis.

A cisticercose bovina, uma doença cosmopolita causada pela Taenia saginata, resulta em perdas econômicas devido á desvalorização de carcaças durante o abate. A inspeção sanitária nos frigoríficos, método de diagnóstico de rotina no Brasil, não possui sensibilidade necessária para detectar animais levemente infectados, os quais são tipicamente encontrados no Brasil. Neste estudo testou-se soro de animais diagnosticados positivos e negativos pela inspeção veterinária por (1) anticorpos anti-parasita usando antígenos de metacestóides (fluido vesicular de T. solium e secreções de T. saginata) e (2) antígeno secretado de metacestóides viáveis. Os pontos de corte foram calculados pela curva ROC, considerando condições de intensa e leve infeção, e pelo método clássicoo ( X + 2DP das amostras negativas).. A sensibilidade e a especificidade dos testes diagnósticos foram diferentes dependendo do valor de ponto de corte assumido e, sobretudo, se a infecção era intensa ou leve. Apesar destas observações, no entanto, tanto o ensaio ELISA para anticorpos séricos quanto para antígeno de parasita constituem importante ferramenta para propósitos epidemiológicos e no estabelecimento de prioridades no controle da cisticercose bovina.

Detection of Cryptosporidium parvum oocysts in calf fecal samples by direct immunofluorescence assay / Detecção de oocistos de Cryptosporidium parvum em amostras fecais de bezerros pela reação de imunofluorescência direta

The aim of this study was to produce a conjugate containing anti-Cryptosporidium parvum polyclonal antibodies and standardize a Direct Immunofluorescence Assay (DIF) for detecting C. parvum oocysts in fecal samples from calves. In order to obtain anti-C. parvum polyclonal antibodies, two New Zealand rabbits were immunized with a purified solution of C. parvum oocysts and Freund's adjuvant. Purification of the immunoglobulin G (IgG) fraction was performed by means of precipitation in ammonium sulfate and chromatography using a DEAE-cellulose column. The anti-C. parvum polyclonal antibody titer was determined by means of the enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The rabbit anti-C. parvum IgG fraction was conjugated with fluorescein isothiocyanate and standardization of the DIF was performed using various dilutions of conjugate on slides positive for C. parvum oocysts. The cross-reactivity of the anti-C. parvum conjugate was tested using oocysts of Cryptosporidium serpentis, Cryptosporidium andersoni, Escherichia coli, Eimeria sp., and Candida sp. An anti-C. parvum conjugate was successfully produced, thus allowing standardization of DIF for detection of Cryptosporidium oocysts in fecal samples. Cross-reactivity of anti-C. parvum polyclonal antibodies with C. andersoni and C. serpentis was also observed.

O objetivo deste estudo foi produzir um conjugado contendo anticorpos policlonais anti-Cryptosporidium parvum e padronizar a Reação de Imunofluorescência Direta (RID), para detecção de oocistos de C. parvum em amostras fecais de bezerros. Para produção de anticorpos policlonais anti-C. parvum, dois coelhos da raça Nova Zelândia foram imunizados com uma solução purificada de oocistos de C. parvum e adjuvante de Freund. A purificação da fração de imunoglobulina G (IgG) foi realizada por meio de precipitação em sulfato de amônio e cromatografia em coluna de DEAE celulose. A titulação dos anticorpos policlonais anti-C. parvum foi determinada por meio de ensaio imunoenzimático (ELISA). A fração IgG de coelho anti-C. parvum foi conjugada com isotiocianato de fluoresceína, e a padronização da RID foi feita utilizando-se várias diluições do conjugado, em lâminas positivas para C. parvum. Foi pesquisada também a presença de reatividade cruzada do conjugado anti-C. parvum com C. serpentis, C. andersoni, Escherichia coli, Eimeria sp. e Candida sp.. A produção do conjugado anti-C. parvum foi bem sucedida, sendo possível a padronização da RID para detecção de oocistos em fezes. Foi também observada reatividade cruzada dos anticorpos policlonais anti-C. parvum, com C. andersoni e C. serpentis.

Diagnóstico de criptosporidiose em amostras fecais de bezerros por imunofluorescência direta e microscopia de contraste de fase / Diagnosis of cryptosporidiosis in fecal samples of calves using direct immunofluorescence and phase contrast microscopy

O presente estudo teve como objetivo comparar as técnicas de imunofluorescência direta (IFD) e a microscopia de contraste de fase em solução de Sheather (MCF), para detecção de oocistos de Cryptosporidium spp. em amostras fecais de bezerros. A determinação dos limiares detecção da IFD e da MCF foi realizada utilizando cinco alíquotas de uma amostra fecal de bezerro, comprovadamente negativa para Cryptosporidium spp., adicionadas com diferentes quantidades de oocistos de Cryptosporidium parvum. Ao exame das 5 alíquotas, a IFD e a MCF apresentaram, respectivamente, limiares de detecção de 3,3x104 (duas alíquotas positivas) e 3,3x105 oocistos (1 alíquota positiva) por grama de fezes. Foram também realizadas a comparação entre a positividade obtida e uma análise semiquantitativa do número de oocistos observados por campo de microscopia, em ambos os métodos, em 300 amostras fecais de bezerros. Entre as 300 amostras, 19,7 por cento (59/300) foram positivas pela IFD, com diferença estatisticamente significante (P=0,0098) quando comparada com a positividade obtida pela MCF, que foi de 11,7 por cento (35/300). As amostras positivas foram submetidas à reação em cadeia da polimerase para amplificação de fragmentos da subunidade 18S do rRNA, com posterior sequenciamento dos fragmentos amplificados, o que permitiu a identificação de Cryptosporidium andersoni em 11,9 por cento (7/59) e de C.parvum em 88,1 por cento (52/59) das amostras. Os resultados observados comprovam que a IFD foi mais eficiente que a MCF para detecção de oocistos de Cryptosporidium spp. em amostras fecais de bezerros.

This study aimed to compare the direct immunofluorescence assay (DIF) and the phase contrast microscopy in Sheather solution (PCM) for detection of Cryptosporidium oocysts in fecal samples from calves. The determination of the thresholds of detection of DIF and PCM was performed using five aliquots of a fecal sample from a calf negative for Cryptosporidium spp. oocysts, spiked with different amounts of Cryptosporidium parvum oocysts. The screening of the five aliquots revealed that the DIF and MCF showed respectively, detection thresholds of 3.3x104 (2 positive aliquots) and 3.3x105 (1 positive aliquot) oocysts per gram of fecal sample. Further analyses were accomplished in order to compare the positivity results and to determine semi-quantitatively the number of oocysts per field of microscopy, in both methods, in 300 fecal samples from calves. Among the 300 samples, 19.7 percent (59/300) were positive by DIF, result that was statistically significant (P=0.0098) when compared with the positivity obtained by the PCM, which was 11.7 percent (35/300). The positive samples were submitted to the nested-PCR assay for amplification of fragments of the 18S subunit of rRNA, following sequencing of amplified fragments, allowing the identification of Cryptosporidium andersoni in 11.9 percent (7/59) and C. parvum in 88.1 percent (52/59) of the samples. The present results indicate that the DIF was more effective than PCM in the detection of Cryptosporidium in fecal samples from calves.

Animal cysticercosis in indigenous Brazilian villages / Cisticercose animal em aldeias indígenas brasileiras

Sanitary inspection of beef and pork meat has been the major tool for diagnosing animal cysticercosis and for preventing taeniasis in Brazil. The indigenous villages Jaguapiru and Bororo are located close to the urban area of the municipality of Dourados in the State of Mato Grosso do Sul, Brazil, where precarious basic sanitation conditions are observed. Both cattle and pigs are raised for self-consumption of meat and milk as well as for sale on the external market, generally without official sanitary inspection. In this study, 96 bovine carcasses and 117 pig blood serum samples from animals raised in these indigenous villages were evaluated for the presence of metacestodes by postmortem evaluation, and anti-Taenia sp. antibodies were investigated using the indirect ELISA test. Metacestode forms were observed in 18.7 percent of the bovine carcasses, and 9.4 percent of the pig serum samples were positive for anti-Taenia sp. antibodies. The occurrence of animal cysticercosis in the villages may favor the occurrence of this zoonosis in the indigenous populations. Enforcement of proper slaughter and sanitary inspection conditions are urgently needed for controlling the taeniasis-cysticercosis complex among the indigenous population.

A inspeção sanitária da carne bovina e suína tem sido a principal forma diagnóstica da cisticercose animal e da prevenção da teníase no Brasil. As aldeias indígenas Jaguapirú e Bororó estão localizadas próximo à área urbana do município de Dourados-MS, com condições precárias de saneamento básico, onde bovinos e suínos são criados como fonte de alimento para consumo próprio, bem como para comercialização externa, geralmente sem inspeção sanitária oficial. Neste estudo, 96 carcaças bovinas e 117 amostras de soro de suínos, criados nas aldeias indígenas, foram avaliadas para a presença de formas metacestóides à inspeção sanitária e de anticorpos anti-Taenia sp. ao teste ELISA, respectivamente. Observaram-se 18,75 por cento de positividade para cisticercose bovina e 9,4 por cento para cisticercose suína. A ocorrência do complexo teníase-cisticercose nas aldeias pode favorecer a ocorrência desta zoonose na população indígena. Condições adequadas de abate e inspeção sanitária dos animais destas aldeias se fazem urgente para o controle do complexo teníase-cisticercose na população indígena.

Comparação entre dois métodos de detecção de DNA de papilomavírus humano em carcinoma epidermoide de lábio / Comparison between two methods for human papilomavírus DNA detection in lip squamous cell carcinoma

Introdução: Recentemente o papilomavírus humano (HPV) tem sido associado à carcinogênese oral. A metodologia empregada na detecção do vírus é uma das maiores causas observadas da grande variabilidade nas taxas de detecção do HPV. Objetivo: Este estudo comparou a sensibilidade de detecção do DNA do HPV em casos de carcinoma epidermoide de lábio utilizando a amplificação do DNA viral por reação em cadeia da polimerase (PCR) ou nPCR. Material e método: Foram utilizadas 33 amostras provenientes de casos de carcinoma epidermoide de lábio. Para as extrações do DNA utilizou-se o sistema QIAamp DNA Mini Kit. Como controle interno utilizou-se o gene da b-globina. Das 33 amostras iniciais, 30 foram positivas para o gene b-globina, sendo utilizadas para detectar o DNA viral. Comparou-se a amplificação do DNA viral pelos métodos da PCR com os oligonucleotídeos MY09/MY11 e nPCR, empregando-se os pares de oligonucleotídeos iniciadores MY09/MY11 e, na segunda etapa, o par GP5+/GP6+. O controle positivo para a presença do DNA do HPV utilizado foi a linhagem de células HeLa e, como controle negativo, a mistura de amplificação sem DNA. A análise dos produtos de PCR e nPCR para HPV foi realizada por eletroforese em gel de poliacrilamida a 8 por cento. Resultados: Utilizando-se o método da PCR, a amplificação do DNA do HPV foi constatada em dois casos. Com a nPCR foi verificada presença de DNA viral em 13 das 30 amostras. Conclusão: Com a utilização da nPCR, a detecção do HPV nos casos estudados aumentou mais de seis vezes.

Introduction: Human papillomavirus (HPV) has been currently associated with oral carcinogesis. The methodology applied in virus detection is one of the main reasons for the great variability observed in HPV detection. Objectives: This study compared HPV DNA detection efficiency in lip squamous cell carcinoma samples (SCC) using viral DNA amplification by PCR or nPCR. Methods: Thirty three samples of lip squamous cell carcinoma were selected. DNA extractions were performed with QIAamp DNA minikit. The internal control was b-globin gene. Thirty out of 33 initial samples were positive for b-globin gene, which were employed to detect viral DNA. The amplification of viral DNA was compared by PCR method through MY09/MY11 oligonucleotides and nPCR through MY09/MY11 oligonucleotides in the first stage and GP5+/GP6+ in the second stage. HeLa cells were used as positive control for HPV DNA presence and the amplification mixture without DNA as negative control. The analysis of PCR and nPCR products for HPV DNA was performed through gel electrophoresis in polyacrylamide at 8 percent. Results: HPV DNA amplification was verified in two cases by the use of PCR method. HPV DNA presence was verified in 13 out of 30 samples by the use of nPCR. Conclusion: HPV DNA detection of lip SCC increased sixfold in the studied cases with the employment of nPCR.

Estudo comparativo dos métodos diagnósticos para Leishmaniose Visceral em cães oriundos de Ilha Solteira, SP / Comparative study of diagnostic methods for visceral leishmaniasis in dogs from Ilha Solteira, SP

O objetivo da presente pesquisa foi avaliar comparativamente os métodos diagnósticos da Leishmaniose Visceral Canina (LVC), utilizando-se o ensaio imunoenzimático indireto (ELISA), a reação de imunofluorescência indireta (RIFI), a histoquímica (HE) e a imunoistoquímica (IMIQ) em tecidos de órgãos, como o baço, linfonodo e fígado. Além disso, a Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR) das amostras de sangue e dos tecidos foi utilizada para comparar e confirmar os diagnósticos negativos e não conclusivos pelos métodos acima. Para esse estudo, foram utilizados 34 cães com diferentes sintomas da LVC, classificados em polissintomáticos, oligossintomáticos e assintomáticos e eutanasiados no Centro de Controle de Zoonoses (CCZ) de Ilha Solteira, SP. Os índices de positividade para os testes ELISA, IMIQ, RIFI e HE foram de 65,0, 62,0, 56,0 e 56,0 por cento, respectivamente, sendo a maior positividade detectada nos cães polissintomáticos (92,0 por cento), seguida pelos oligossintomáticos (57,0 por cento) e assintomáticos (12,5 por cento). A PCR confirmou os resultados positivos pelas outras técnicas e ainda detectou DNA do parasita nos tecidos de 100 por cento dos cães negativos e em 89,0 por cento dos suspeitos, elevando para 97,0 por cento a positividade. Em conclusão, a PCR demonstrou ser o método mais sensível e preciso para o diagnóstico definitivo da LVC.

The purpose of the present work was a comparative study of diagnostic methods for Canine Visceral Leishmaniasis (CVL) using serological methods, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and indirect fluorescent antibody test (IFAT), histochemical (HE) and immunohistochemical (IMHC) tests using spleen, lymph node and liver canine tissues. In addition, Polymerase Chain Reaction (PCR) was done in blood and in tissues in order to compare and confirm no conclusive and negative diagnosis by the methods above. For this study, 34 dogs were divided according to clinical signs in asymptomatic, oligosymptomatic and polisymptomatic Leishmania-infected dogs euthanized by Zoonotic Disease Control Center (CCZ) from Ilha Solteira, SP, Brazil. The positivism indexes of ELISA, IMHC, IFAT and HE were 65.0, 62.0, 56.0 and 56.0 percent, respectively with the highest numbers of positive dogs in polisymptomatic (92.0 percent) followed by oligosymptomatic (57.0 percent) and asymptomatic dogs (12.5 percent). Furthermore, PCR confirmed the positive results and detected DNA in tissues from 100 percent of negative dogs and 89.0 percent suspects raising the animal positivism index up to 97.0 percent. In conclusion, PCR was the most sensitive and a valuable method for a definitive CVL diagnosis.

Características relatadas sobre animais agressores submetidos ao diagnóstico de raiva, São Paulo, Brasil, 1993-2007 / Characteristics of biting animals submitted to rabies diagnosis, São Paulo State, Brazil, 1993-2007

As pesquisas relativas a agressões por animais baseiam-se em dados de registros de pacientes atendidos nos serviços de vigilância epidemiológica da raiva. Analisaram-se as características de animais agressores, obtidas a partir de dados de 10.616 fichas de envio de amostras para diagnóstico da raiva na região noroeste do Estado de São Paulo, Brasil, entre 1993-2007. Desse total de fichas, 61,5 por cento continham informações sobre agressão e, dentre os animais agressores (25 por cento), a maioria foi de cães (67 por cento), seguidos por gatos (21,8 por cento) e quirópteros (8,1 por cento). Em 92,1 por cento dos relatos as vítimas eram pessoas e 82,3 por cento dos animais eram domiciliados. A maioria dos cães agressores tinha até um ano de idade. Houve associação significante (p < 0,0001) entre agressividade e sexo, sendo os machos mais agressores do que as fêmeas. Dos animais positivos para raiva, 75,9 por cento (183/241) eram agressores. Os dados obtidos são importantes para a instituição de programas de prevenção de mordeduras, baseados no perfil não só da vítima, mas também do animal agressor, além de permitirem estabelecer fatores de risco para ocorrência de agressões.

Epidemiological factors related to animal bites in humans and other animals were obtained from a database with 10,616 records of animal specimens sent for rabies diagnosis in northwest São Paulo State, Brazil, from 1993 to 2007. Of this total, 61.5 percent contained information on the bites, and among the biting animals (25 percent), the majority were dogs (67 percent), followed by cats (21.8 percent), and bats (8.1 percent). In 92.1 percent of the reports the victims were humans, and 82.3 percent of the animals were home pets. The majority of the biting dogs were less than a year old. There was a significant association (p < 0.0001) between aggressiveness and gender (with male animals more aggressive than females). Of the rabies-positive animals, 75.9 percent (183/241) were biters. The data are important for establishing bite prevention programs based on the profile of both victims and biting animals, besides identifying risk factors for animal bites.

Estudo descritivo da estrutura populacional canina da área urbana de Araçatuba, São Paulo, Brasil, no período de 1994 a 2004 / A descriptive profile of the canine population in Araçatuba, São Paulo State, Brazil, from 1994 to 2004

No período de 1994 a 2004, a população canina de Araçatuba, São Paulo, Brasil, registrou duas importantes zoonoses: a raiva e a leishmaniose visceral. Analisaram-se as mudanças ocorridas nessa população durante esse período, utilizando resultados de censos caninos e de coletas censitárias de sangue realizados em 1994, 1999 e 2004. A relação cão/10 habitantes variou significativamente, passando de 1,7 em 1994 para 2,0 em 1999 e para 1,8 em 2004. A porcentagem de cães com até um ano de idade passou de 20 por cento para 32,5 por cento e o número de eutanásias realizadas também aumentou após 1999, com a introdução da leishmaniose visceral. O número de cães e a estrutura etária variaram nos diversos setores do município e aqueles com maior porcentagem de animais com até dois anos de idade apresentaram maior ocorrência de casos de leishmaniose visceral humana e canina. Tais resultados decorrem de ações de controle adotadas nos setores com casos humanos de leishmaniose visceral, porém, o aumento da população canina mais jovem pode resultar em aumento da susceptibilidade destes cães à doença, favorecendo a manutenção da mesma na área.

From 1994 to 2004, the canine population in Araçatuba, São Paulo State, Brazil, suffered two major canine zoonoses: rabies and visceral leishmaniasis. Changes in the dog population during this period were evaluated using canine census data from 1994 and 2004 and the results of blood samples for diagnosis of canine visceral leishmaniasis in 1999. The ratio of dogs per 10 inhabitants varied from 1.7 in 1994 to 2.0 in 1999 and 1.8 in 2004. The percentage of puppies less than 1 year of age increased from 20 percent to 32.5 percent, and the number of euthanized dogs also increased after 1999, when visceral leishmaniasis began to appear. The number of dogs and percentage of puppies varied between different areas of the city, and neighborhoods with a higher percentage of young animals showed more cases of both human and canine leishmaniasis. This result may be due to control measures applied in these areas in response to cases of human and canine visceral leishmaniasis, but the increase in the younger canine population can be accompanied by increased susceptibility in these animals, thus favoring maintenance of the disease in the area.

Reposição de cães em área endêmica para leishmaniose visceral / Dog replacement in an area endemic for visceral leishmaniasis

Esse trabalho objetivou estimar a reposição de cães em área endêmica para leishmaniose visceral, onde a eutanásia de animais soropositivos é indicada como medida de controle, e avaliar os motivos que levaram a aquisição ou não de novos animais. Houve a reposição em 44,5 por cento dos casos, principalmente devido à necessidade de companhia ou guarda. O principal motivo para a não-reposição foi o temor da leishmaniose visceral.

This study aimed to estimate the dog replacement rate in an area endemic for visceral leishmaniasis, in which slaughter of seropositive animals was indicated as a control measure, and to evaluate the reasons why new animals were or were not acquired. The animals were replaced in 44.5 percent of the cases, and this was done mainly because of the need for a companion or guard dog. The main reason for not replacing the dog was fear of visceral leishmaniasis.

Avaliação de dois métodos de extração de DNA de material parafinado para amplificação em PCR / Evaluation of two methods of DNA extraction from paraffin-embedded material for PCR amplification

INTRODUÇÃO: Diversos métodos para extração de DNA a partir de tecidos biológicos inclusos em parafina encontram-se descritos na literatura, sendo o sucesso desse procedimento de grande importância para a realização de métodos moleculares de diagnóstico empregando a reação em cadeia da polimerase (PCR). OBJETIVO: Este estudo avaliou dois métodos de extração de DNA de material parafinado, visando à amplificação do DNA genômico pela técnica da PCR. MATERIAL E MÉTODO: Foram utilizadas 35 amostras de casos de carcinoma epidermóide de assoalho bucal diagnosticados e tratados no Centro de Oncologia Bucal da Universidade Estadual Paulista (Unesp). Os métodos de extração de DNA avaliados incluíram: 1. digestão com proteinase K seguida por purificação com Chelex 100® (BioRad); e 2. sistema QIAamp DNA minikit® (Qiagen). O DNA obtido foi quantificado por espectrofotometria e amplificado pela técnica da PCR, utilizando-se oligonucleotídeos iniciadores para betaglobina. RESULTADOS: A concentração de DNA obtido do material extraído com o primeiro método apresentou média de 120,62 ng/µl com razão entre as leituras das absorbâncias 260/280 variando de 0,8 a 1,41. Para as amostras extraídas com o segundo procedimento, o rendimento médio foi de 67,38 ng/µl, no entanto a razão 260/280 variou entre 1,11 e 2,53. O material foi submetido à PCR e, das 35 amostras extraídas com cada método, respectivamente, 29 e 30 apresentaram sinal positivo. CONCLUSÃO: Os dois métodos utilizados para obtenção de DNA de material parafinado apresentaram desempenho semelhante, revelando que ambos têm potencial para auxiliar na prática da biologia molecular diagnóstica, assim como no estudo diagnóstico retrospectivo em material parafinizado.

BACKGROUND: There are several methods for DNA extraction from formalin-fixed paraffin-embedded tissues reported in the literature. High success rate on this procedure is important for the use of molecular diagnostic methods based on the polymerase chain reaction (PCR). OBJECTIVE: Two methods of DNA extraction from paraffin-embedded samples were tested aiming at PCR amplification of genomic DNA. MATERIAL AND METHOD: Thirty-five samples were obtained from patients with squamous cell carcinoma of mouth floor treated at the Oral Oncology Center in Universidade Estadual Paulista. The DNA extraction methods included: 1. proteinase K digestion followed by Chelex 100® (BioRad) purification and 2. QIAamp DNA minikit® system (Qiagen). Purified DNA was quantified by spectrophometry and a beta-globin gene fragment was amplified using PCR. RESULTS: The DNA concentration from samples applied to the first method presented an average of 120.62 ng/µl and absorbance ratio 260/280 varying between 0.8 and 1.41. From the samples extracted using the second procedure, the mean DNA concentration was 67.38 ng/µl, with absorbance ratio varying between 1.11 and 2.53. DNA samples were submitted to PCR and from 35 samples extracted with both methods, respectively, 29 and 30 were successfully amplified for the beta-globin gene. CONCLUSION: Both methods used to obtain genomic DNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissues presented similar performance, revealing their potential to be included in diagnosis of molecular biology, as well as in retrospective studies using archived paraffin-embedded samples.

Fecal specimens preparation methods for PCR diagnosis of human taeniosis

Com o intuito de utilizar a Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR) como método de diagnóstico diferencial da teníase humana, avaliaram-se alguns protocolos de preparação e extração de DNA de ovos de Taenia saginata presentes em amostras de fezes de paciente naturalmente infectado. O DNA obtido após extração com fenol/clorofórmio/álcool isoamílico ou DNAzol® teve que ser purificado antes da PCR para que fosse possível a amplificação dos fragmentos de 170 pb e 600 pb desejados. Com o kit QIAmp DNA stool mini kit® tal purificação não foi necessária. Os melhores resultados foram observados após o tratamento prévio das amostras com pérolas de vidro, tanto quando da utilização de fenol/clorofórmio/álcool isoamílico, quando de DNAzol® ou QIAmp DNA stool mini kit®.

Detecção de Leptospira pomona em sêmen bovino por eletroforese capilar fluorescente / Detection of Leptospira pomona in bovine semen by fluorescent capillary eletrophoresis

Este estudo pretendeu avaliar o limiar de detecção da técnica de PCR aliada à eletroforese capilar para diagnóstico da Leptospira pomona em sêmen bovino. Doses inseminantes livres de patógenos foram contaminadas experimentalmente com Leptospira pomona em escalas que variavam de 10(elevado a 0) a 10(elevado a 7) bactérias/ml e submetidas à extração de DNA pelo método de fenol/clorofórmio. Após a reação de PCR, a visualização dos fragmentos foi realizada em três tipos de eletroforese: agarose 2% sob luz UV, acrilamida 8% corado com prata e eletroforese capilar fluorescente. A detecção de DNA de Leptospira pomona em sêmen bovino através de eletroforese capilar fluorescente foi possível a partir de concentração de 10(elevado a 2 )bactérias/ml. Nos métodos de eletroforese em agarose 2%, observou-se limite de detecção de 10(elevado a 4 )bactérias/ml e em gel de poliacrilamida 8% o limite de detecção foi de 10(elevado a 2 )bactérias/ml. A eletroforese capilar demonstrou ser uma alternativa eficaz e rápida na detecção de DNA de Leptospira em sêmen bovino podendo ser uma valiosa ferramenta para controle de qualidade do sêmen produzido em centrais de inseminação artificial dada a facilidade de automação desse processo.

This study was performed in order to evaluate the detection limit of PCR with fluorescent capillary electrophoresis for Leptospira pomonadiagnosis in bovine semen. Negative bovine semen samples were artificially contaminated with Leptospira pomona 10(involution 0) to 10(involution 7 ) bacteria/ml) and DNA was extracted by phenol/chloroform protocol. DNA fragments visualization was done by three electrophoresis methods: under UV light in 2 % agarose gel, silver staining 8% polyacrylamide gel and fluorescent capillary electrophoresis. The detection limit of capillary electrophoresis for Leptospira pomona was 10(involution 2) bacteria/ml. Under UV light, in 2 % agarose gel, the detection limit was of 10(involution 4) bacteria/ml while for silver stained 8 % polyacrylamide gel it was 10(involution 2) bacteria/ml. PCR with fluorescent capillary electrophoresis is an efficient andrapid diagnostic test for DNA detection of Leptospira in bovine semen and this can be an important tool for herd and semen sanitary controlin artificial insemination centers.

Canine rabies epidemiology in Araçatuba and neighborhood, Northwestern São Paulo State - Brazil

São apresentadas algumas características epidemiológicas da raiva canina na região de Araçatuba, no período de 1993 a 1997. Dentre 1.984 cães submetidos ao diagnóstico de raiva, 351 foram positivos sendo que 89 por cento dos casos (312/351) ocorreram na zona urbana e destes, 85 por cento (266/312) eram de animais com proprietário. As informações sobre sexo estavam presentes em 83 por cento das fichas e destas 61 por cento eram de machos. A média de idade dos cães positivos foi de 34 meses. A agressividade foi um dos sintomas mais comumente observado (77 por cento), seguido por incoordenação motora e/ou paralisia (42 por cento) e 48 por cento dos cães positivos haviam agredido pessoas ou outros animais. Das 182 fichas epidemiológicas que possuíam dados de vacinação, 51 por cento (92/182) dos cães não eram vacinados. Aponta-se como possíveis razões para o aparecimento da epidemia no município de Araçatuba a baixa cobertura vacinal demonstrada pelo índice de cães não vacinados que adquiriram a doença aliado à elevada relação cão/homem (1:3,5) revelada em estudo anterior.

Prevalência de criptosporidiose em bezerros na regiäo de Araçatuba, Estado de Säo Paulo, Brasil / Prevalence of cryptosporidiosis in calves from Araçatuba region, Säo Paulo State, Brazil

Avaliou-se a prevalência de oocistos de Cryptosporidium parvum em amostras de fezes de 459 bezerros com até 30 dias de idade e em amostras de água e piso dos bezerreiros de 33 propriedades leiteiras na regiäo de Araçatuba-Estado de Säo Paulo. A maior porcentagem de excreçäo de oocistos foi verificada em bezerros com faixa etária variando entre oito e 14 dias de idade (14,5 por cento) sendo, a menor taxa (6,4 por cento), detectada no grupo de animais mais velhos (22 a 30 dias de vida). Observaram-se, na amostragem total, valores positivos aproximados de 10,26 por cento pelo ensaio de imunoadsorçäo enzimática e de 12,4 por cento pelo teste de Sheather. As amostras de água foram negativas e duas de solo positivas.

Toxocariasis: serological diagnosis by indirect antibody competition ELISA

A toxocariase, uma emergente zoonose, e uma sindrome clinica decorrente da infeccao humana por larvas de Toxocara canis e Toxocara cati, parasitas intestinais de caes e gatos, respectivamente. A dificuldade de deteccao das larvas nos tecidos e a inespecificidade dos sinais clinicos tornam os testes sorologicos os meios diagnosticos mais adequados. Os antigenos excretores-secretores de T. canis empregados nos testes sorologicos, embora tenham contribuido para melhorar a especificidade destes, apresentam reacoes cruzadas com diversos parasitas, particularmente com Ascaris sp. Com o intuito de aumentar a especificidade do diagnostico sorologico da toxocariase que rotineiramente e feito atraves do metodo de ELISA indireto, no presente trabalho desenvolveu-se um metodo de ELISA indireto de competicao (EIC), utilizando IgG anti-TES produzida em coelhos e absorvida com um polimero de extrato antigenico de adultos de A. suum...